Agus Budiharta lulus dari Sekolah Inspektur Polisi Sumber Sarjana atau Sepa pada tahun 1988.
Di Kepolisian RI, Agus Budiharta memiliki karier panjang.
Jenderal yang berpengalaman dalam bidang Forensik Kepolisian ini pernah menduduki sejumlah jabatan strategis dalam Puslabfor Polri, antara lain:
1. Pemeriksa Muda Puslabfor Polri (1991).
2. Panit Bahan Kimia Forensik Puslabfor Bareskrim Polri (1995).
3. Kanit Riksa Uang Palsu Subbid Upal Puslabfor Bareskrim Polri (2002).
3. Kasubbagren Set Puslabfor Bareskrim Polri (2006).
4. Wakalabforcab Palembang Bareskrim Polri (2008).
5. Analis Utama Puslabfor Bareskrim Polri (2010).
6. Kabiddokupalfor Puslabfor Bareskrim Polri (2010).
7. Kalabforcab Denpasar Bareskrim Polri (2012).
8. Kalabforcab Surabaya Bareskrim polri (2014).